Recargo de Equivalencia en farmacia: qué es, cómo se aplica y cómo automatizarlo

Equipo FarmaFactu10 de febrero de 20265 min de lectura
recargo de equivalencia

Recargo de Equivalencia en farmacia: qué es, cómo se aplica y cómo automatizarlo

Resumen rápido

Guía completa sobre el Recargo de Equivalencia en farmacias españolas. Qué productos lo llevan, cómo calcularlo y cómo gestionarlo automáticamente.
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Publicado10 de febrero de 2026
Lectura estimada5 min
Categoría principalrecargo de equivalencia
Última actualización18 de mayo de 2026
Fiscalidad farmacéutica

Recargo de Equivalencia en farmacia

El Recargo de Equivalencia (RE) es uno de los temas fiscales más confusos para titulares de farmacia y gestorías especializadas. En este artículo explicamos qué es exactamente, qué productos lo llevan, cómo calcularlo correctamente y cómo automatizar su gestión para evitar errores costosos.

Qué es el Recargo de Equivalencia

El Recargo de Equivalencia es un régimen especial del IVA que se aplica obligatoriamente a comerciantes minoristas que venden productos sin transformarlos. En el caso de las farmacias, esto afecta a la venta de parafarmacia y productos no farmacéuticos.

Por qué existe el RE

La lógica del RE es simplificar la tributación de los minoristas. En lugar de que el comerciante lleve contabilidad de IVA repercutido y soportado, paga un recargo adicional en sus compras y queda liberado de presentar declaraciones de IVA por esas ventas.

Medicamentos

  • NO llevan RE
  • Están exentos por ser productos sanitarios
  • Se declaran normalmente en el modelo 303

Parafarmacia y productos comerciales

  • SÍ llevan RE
  • Incluye cosméticos, complementos, etc.
  • No requieren declaración de IVA en ventas

Tipos de Recargo de Equivalencia vigentes en 2026

Tipo de IVARecargo de Equivalencia
21% (general)5,2%
10% (reducido)1,4%
4% (superreducido)0,5%

Ejemplo práctico

Si compra un producto de parafarmacia con IVA al 21%, el proveedor le cobrará adicionalmente un 5,2% de RE sobre la base imponible.

Cómo se refleja el RE en las facturas de mayoristas

Las facturas de Cofares, Alliance, Bidafarma y otros mayoristas farmacéuticos muestran el RE de forma diferente según el proveedor. Esto es fuente habitual de confusión y errores.

Estructura típica de una factura con RE

Una factura de mayorista con productos mixtos (medicamentos + parafarmacia) tendrá:

1

Líneas de productos farmacéuticos

Base + IVA (sin RE)

2

Líneas de productos comerciales

Base + IVA + RE

3

Totales segregados

Subtotal farmacia, subtotal parafarmacia, RE total

El problema: cada mayorista lo muestra diferente

Cofares

Muestra el RE en una línea separada al final de la factura.

Alliance

Integra el RE en cada línea de producto individual.

Bidafarma

Desglosa por tipo de IVA con RE asociado a cada tramo.

Inconsistencia entre mayoristas

Esta inconsistencia hace que los OCR genéricos fallen sistemáticamente al interpretar el RE. Un software especializado en farmacia debe reconocer cada formato.

Errores comunes con el Recargo de Equivalencia

Error 1: Aplicar RE a medicamentos

Los medicamentos nunca llevan RE. Si su sistema está aplicando RE a productos farmacéuticos, está calculando mal y pagará de más o tendrá descuadres.

Error 2: No verificar la base del RE

El RE se calcula sobre la base imponible, no sobre el total con IVA. Un error frecuente es calcular el RE sobre importes que ya incluyen IVA.

Error 3: Confundir RE con IVA soportado deducible

El RE pagado NO es deducible como el IVA soportado normal. Es un coste que asume el minorista a cambio de no tener que declarar IVA en ventas de parafarmacia.

Error 4: No segregar correctamente en la contabilidad

A efectos contables, el RE debe registrarse por separado del IVA. Si su gestoría mezcla ambos conceptos, la contabilidad no reflejará correctamente los costes reales.

Cómo automatizar la gestión del RE

La gestión manual del RE implica:

Tareas manuales de gestión del RE

Identificar qué líneas de cada factura llevan RE
Verificar que los porcentajes son correctos
Calcular los totales por tipo de IVA y RE
Registrar correctamente en contabilidad
Generar reportes para la gestoría

Lo que hace FarmaFactu automáticamente

Detección automática de productos con RE

El OCR identifica qué líneas son medicamentos (sin RE) y cuáles son parafarmacia (con RE).

Validación matemática

Verifica que base + IVA + RE = total línea. Si no cuadra, marca para revisión.

Segregación por tipo

Genera totales separados para medicamentos y parafarmacia automáticamente.

Export a A3/Sage con RE correcto

La exportación incluye el RE por separado para que la gestoría lo asigne a las cuentas correctas al importar.

Histórico para auditorías

FarmaFactu conserva el PDF original junto con la extracción para cualquier verificación futura.

El RE en el cierre trimestral

Cada trimestre, la gestoría debe presentar:

  • Modelo 303 (IVA): Incluye el IVA soportado y repercutido de la actividad general
  • Modelo 131/130 (pagos fraccionados): Refleja los beneficios de la actividad

Importante sobre el 303

El RE no aparece en el 303 porque no es IVA deducible. Es un coste de compras que afecta al margen bruto de parafarmacia.

Implicación para el cálculo de márgenes

Si está analizando la rentabilidad de su sección de parafarmacia, debe incluir el RE como coste de producto:

Fórmula de coste real
Coste real parafarmacia = Precio neto + IVA no deducible + RE

Error frecuente en márgenes

Si solo cuenta el precio neto, estará sobreestimando su margen real entre un 1,4% y un 5,2% según el tipo de IVA.

Preguntas frecuentes sobre el RE en farmacia

Preguntas frecuentes

Conclusión

El Recargo de Equivalencia es un régimen fiscal que simplifica la tributación del minorista pero complica la gestión de facturas de compras. La clave está en:

Claves para gestionar el RE correctamente

Entender qué productos llevan RE y cuáles no
Verificar que las facturas de mayoristas aplican el RE correctamente
Registrar el RE por separado del IVA en contabilidad
Usar software especializado que automatice la detección y cálculo

La solución automática

FarmaFactu detecta automáticamente las líneas con RE, valida los cálculos y genera exports correctos para A3/Sage. Esto elimina horas de trabajo manual y reduce errores en el cierre.


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